近日，20家美國著名學(xué)術(shù)機構(gòu)、藥物診斷開發(fā)商的聯(lián)合項目--液體活檢數(shù)據(jù)庫Blood Profiling Atlas正式啟動。作為癌癥登月計劃的一部分，該項目旨在推進(jìn)血液分析與診斷技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展。

據(jù)了解，該數(shù)據(jù)庫將協(xié)調(diào)匯總美國各科研院所和醫(yī)院的循環(huán)瘤細(xì)胞（CTC）、循環(huán)瘤DNA（ctDNA）、外泌體檢測的原始數(shù)據(jù)和選擇性臨床數(shù)據(jù)并向大家免費提供。

作為該項目成員之一的Seven Bridges市場總監(jiān)Andrew Gruen告訴記者，“我們的目標(biāo)是在未來的45-60天內(nèi)實現(xiàn)大量臨床數(shù)據(jù)的分析歸位與深度挖掘。”

日前， 作為生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件開發(fā)商的Seven Bridges正與芝加哥大學(xué)合作策劃此項目的數(shù)據(jù)庫部分。 該公司表示將致力于提供為期六個月的工程學(xué)、生物信息學(xué)服務(wù)以及高達(dá)50萬美金的計算和存儲信息資金以促進(jìn)分析軟件的開發(fā)與應(yīng)用。項目負(fù)責(zé)人Gruen表示，“如果我們能成功做到這一點，那么我們將開始一項偉大的前瞻性研究，真正了解我們所擁有幾百億的數(shù)據(jù)。”

該項目涉及的血液樣品來自于包括阿斯利康、禮來制藥、Epic Sciences 、斯隆凱特林癌癥中心（MSK）、Foundation Medicine、Genentech、Guardant Health、Personal Genome Diagnostics(PGDx)、諾華、輝瑞在內(nèi)的13家企業(yè)與科研機構(gòu)。

MSK（斯隆凱特林癌癥中心）表示其愿意分享血液樣本收集的方法、不同處理方法的無細(xì)胞核酸分析比較結(jié)果以及來自轉(zhuǎn)移性前列腺癌患者的CTC數(shù)據(jù)。 這些數(shù)據(jù)都將有助于解釋以往治療效果的影響。

MSK研究學(xué)者Scher博士強調(diào)道：“前列腺癌是一種很難以活檢方法確認(rèn)的癌癥，它不在腫塊間擴散，而是浸潤骨髓，這就使得它難以被檢測出來。因此，我們將基于Epic Sciences的實驗方法在表型和基因組水平上進(jìn)一步提供前列腺癌的CTC表征數(shù)據(jù)。并正與Epic合作一種細(xì)胞分類方法，即如果細(xì)胞看起來相似，那么他們可能有類似的遺傳改變，由此來達(dá)到分類細(xì)胞的目的。”

此外，PGDx也將提交來自500個樣本的數(shù)據(jù)，并與其生物制藥實驗室的合作伙伴一起將所生成的數(shù)據(jù)傳輸?shù)紸tlas終端。 PGDx將免費共享其腫瘤譜分析平臺上的專業(yè)知識、協(xié)議和非專有ctDNA分析數(shù)據(jù)。

PGDx轉(zhuǎn)化科學(xué)與診斷專家John Simmons博士指出，該數(shù)據(jù)庫的啟動對精準(zhǔn)腫瘤學(xué)領(lǐng)域的起步至關(guān)重要，可以讓人們更全面地了解如何使用液體活檢以及應(yīng)用液體活檢時應(yīng)注意的各種影響因素。

同時，密歇根大學(xué)的四個研究團(tuán)隊也將共享其研究數(shù)據(jù)，包括多癌癥患者的全基因組測序數(shù)據(jù)、乳腺癌患者的無漿腫瘤細(xì)胞的DNA和PCR數(shù)據(jù)、健康個體的血漿RNAseq數(shù)據(jù)以及乳腺癌患者血液樣品中分離的循環(huán)腫瘤細(xì)胞數(shù)和蛋白質(zhì)標(biāo)記數(shù)據(jù)等。

去大部分科研機構(gòu)和產(chǎn)業(yè)機構(gòu)不同，諾華集團(tuán)則強調(diào)評估包括基于PCR方法和基于下一代測序方法的cfDNA檢測技術(shù)。諾華發(fā)言人Tina Tuttle并強調(diào)，諾華公司將分享用于ctDNA血漿收集的SOP、不同廠商的ctDNA提取試劑盒的評價結(jié)果并使用設(shè)計樣品評價ctDNA檢測技術(shù)的臨床性能。